Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tk1P04184 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tk1P04184 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tk1P04184 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tk1P04184 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tk1P04184 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tk1P04184 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tk1P04184 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tk1P04184 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tk1P04184 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tk1P04184 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tk1P04184 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tk1P04184 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tk1P04184 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tk1P04184 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms