Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01878 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01878 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01878 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01878 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01878 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01878 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01878 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01878 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01878 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01878 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01878 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01878 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01878 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01878 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01878 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01878 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01878 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01878 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01878 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01878 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01878 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01878 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01878 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01878 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01878 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P01878 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01878 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01878 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01878 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01878 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01878 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01878 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01878 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
P01878 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01878 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01878 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01878 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01878 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01878 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01878 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01878 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01878 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01878 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01878 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
P01878 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01878 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
P01878 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01878 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01878 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01878 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01878 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01878 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01878 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01878 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01878 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01878 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01878 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01878 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P01878 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01878 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01878 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01878 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01878 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01878 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01878 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01878 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01878 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01878 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01878 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01878 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P01878 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P01878 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01878 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01878 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01878 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01878 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
P01878 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01878 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01878 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01878 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P01878 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01878 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01878 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01878 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01878 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01878 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01878 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01878 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01878 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01878 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01878 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01878 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P01878 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01878 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01878 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01878 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01878 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01878 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01878 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms