Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01837 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01837 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01837 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01837 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01837 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01837 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01837 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01837 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01837 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01837 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01837 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01837 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01837 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01837 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01837 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01837 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01837 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01837 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01837 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01837 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01837 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
P01837 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01837 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01837 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01837 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01837 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01837 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01837 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01837 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01837 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01837 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01837 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01837 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01837 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01837 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01837 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01837 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01837 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01837 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01837 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01837 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01837 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01837 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01837 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01837 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01837 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01837 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01837 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01837 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01837 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01837 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01837 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01837 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01837 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01837 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01837 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01837 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01837 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01837 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01837 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01837 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01837 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01837 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01837 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01837 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01837 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01837 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01837 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01837 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01837 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01837 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01837 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01837 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01837 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01837 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01837 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01837 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01837 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01837 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01837 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01837 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01837 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01837 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01837 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01837 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01837 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01837 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01837 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01837 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01837 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01837 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01837 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01837 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01837 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01837 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01837 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01837 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms