Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01791 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01791 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01791 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01791 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01791 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01791 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01791 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01791 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01791 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01791 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01791 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01791 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01791 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01791 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01791 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01791 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01791 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01791 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01791 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01791 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01791 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01791 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01791 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01791 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01791 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01791 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01791 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01791 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01791 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01791 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01791 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01791 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01791 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01791 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01791 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01791 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01791 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01791 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01791 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01791 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01791 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01791 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01791 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01791 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01791 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01791 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01791 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01791 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01791 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01791 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01791 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01791 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01791 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01791 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01791 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01791 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01791 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01791 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01791 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01791 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01791 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01791 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01791 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01791 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01791 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01791 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01791 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01791 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01791 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01791 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01791 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01791 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01791 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01791 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms