Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01748 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01748 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01748 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01748 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01748 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01748 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01748 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01748 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01748 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01748 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01748 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01748 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01748 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01748 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01748 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01748 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01748 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01748 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01748 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01748 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01748 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01748 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01748 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01748 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01748 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01748 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01748 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01748 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01748 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01748 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01748 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01748 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01748 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01748 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01748 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01748 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01748 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01748 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01748 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01748 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01748 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01748 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01748 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01748 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01748 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01748 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01748 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01748 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01748 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01748 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01748 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01748 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01748 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01748 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01748 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01748 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01748 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01748 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01748 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01748 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01748 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01748 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01748 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01748 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01748 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01748 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01748 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01748 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01748 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01748 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01748 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01748 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01748 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01748 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01748 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01748 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01748 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01748 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01748 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01748 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01748 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01748 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01748 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01748 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms