Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01740 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01740 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01740 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
P01740 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01740 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01740 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01740 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01740 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01740 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01740 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
P01740 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01740 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01740 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01740 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01740 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01740 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01740 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01740 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01740 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01740 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01740 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01740 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01740 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01740 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01740 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01740 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01740 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01740 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01740 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01740 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01740 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01740 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01740 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01740 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01740 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01740 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
P01740 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01740 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01740 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01740 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01740 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01740 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01740 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01740 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01740 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01740 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01740 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01740 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01740 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01740 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01740 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01740 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01740 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01740 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01740 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01740 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01740 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01740 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01740 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01740 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01740 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01740 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01740 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01740 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01740 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01740 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01740 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01740 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01740 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01740 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01740 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01740 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01740 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01740 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01740 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01740 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01740 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01740 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01740 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01740 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01740 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
P01740 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01740 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01740 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01740 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01740 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01740 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms