Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01658 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01658 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01658 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01658 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01658 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01658 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01658 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01658 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01658 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01658 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01658 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01658 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01658 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01658 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01658 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01658 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01658 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01658 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01658 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01658 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01658 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01658 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01658 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01658 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01658 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01658 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01658 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01658 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01658 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01658 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01658 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01658 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01658 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01658 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01658 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01658 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01658 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01658 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01658 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01658 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01658 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01658 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01658 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01658 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01658 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01658 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01658 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01658 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01658 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01658 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01658 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01658 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01658 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01658 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01658 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01658 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01658 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01658 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01658 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01658 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01658 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01658 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01658 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01658 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01658 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01658 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01658 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01658 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01658 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01658 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01658 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01658 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01658 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01658 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01658 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01658 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01658 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01658 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01658 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01658 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01658 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01658 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01658 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01658 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01658 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01658 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01658 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01658 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01658 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01658 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01658 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01658 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01658 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01658 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01658 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01658 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01658 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01658 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01658 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms