Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01635 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01635 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01635 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01635 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01635 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01635 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01635 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01635 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01635 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01635 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01635 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01635 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01635 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01635 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01635 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01635 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01635 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01635 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01635 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01635 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01635 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01635 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01635 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01635 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01635 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01635 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01635 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01635 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01635 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01635 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01635 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01635 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01635 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01635 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01635 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01635 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01635 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
P01635 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01635 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01635 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01635 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01635 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01635 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01635 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01635 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P01635 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
P01635 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01635 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01635 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01635 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01635 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01635 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01635 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01635 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01635 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01635 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01635 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01635 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01635 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01635 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01635 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01635 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01635 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01635 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01635 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01635 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01635 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01635 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01635 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01635 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01635 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01635 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01635 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01635 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01635 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01635 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01635 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01635 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01635 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
P01635 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01635 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01635 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01635 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01635 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01635 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
P01635 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01635 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01635 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01635 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01635 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01635 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01635 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01635 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01635 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01635 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01635 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01635 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01635 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01635 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms