Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifnb1P01575 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnb1P01575 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms