Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vti1aO89116 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vti1aO89116 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.8 ms