Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Apaf1O88879 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Apaf1O88879 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms