Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tom1O88746 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Tom1O88746 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tom1O88746 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tom1O88746 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Tom1O88746 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tom1O88746 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tom1O88746 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tom1O88746 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tom1O88746 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tom1O88746 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tom1O88746 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tom1O88746 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tom1O88746 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Tom1O88746 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tom1O88746 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tom1O88746 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tom1O88746 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tom1O88746 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tom1O88746 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tom1O88746 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms