Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops6O88545 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cops6O88545 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cops6O88545 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cops6O88545 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cops6O88545 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cops6O88545 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cops6O88545 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cops6O88545 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cops6O88545 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cops6O88545 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cops6O88545 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cops6O88545 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cops6O88545 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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