Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZfrO88532 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZfrO88532 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZfrO88532 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfrO88532 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZfrO88532 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZfrO88532 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZfrO88532 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZfrO88532 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZfrO88532 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZfrO88532 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZfrO88532 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZfrO88532 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZfrO88532 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZfrO88532 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZfrO88532 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms