Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CntfrO88507 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CntfrO88507 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CntfrO88507 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CntfrO88507 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CntfrO88507 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CntfrO88507 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CntfrO88507 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms