Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnal1O88327 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms