Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mid1O70583 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mid1O70583 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mid1O70583 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid1O70583 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid1O70583 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid1O70583 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1O70583 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mid1O70583 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms