Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd2O70572 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd2O70572 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smpd2O70572 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.4 ms