Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk1O70551 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Srpk1O70551 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srpk1O70551 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srpk1O70551 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms