Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CtssO70370 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtssO70370 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtssO70370 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CtssO70370 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtssO70370 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtssO70370 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtssO70370 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtssO70370 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtssO70370 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtssO70370 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtssO70370 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CtssO70370 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtssO70370 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtssO70370 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtssO70370 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtssO70370 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtssO70370 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CtssO70370 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtssO70370 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtssO70370 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtssO70370 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtssO70370 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtssO70370 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtssO70370 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtssO70370 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtssO70370 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtssO70370 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtssO70370 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtssO70370 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtssO70370 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtssO70370 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtssO70370 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtssO70370 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtssO70370 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtssO70370 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CtssO70370 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtssO70370 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtssO70370 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CtssO70370 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CtssO70370 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CtssO70370 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtssO70370 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CtssO70370 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CtssO70370 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtssO70370 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtssO70370 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtssO70370 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtssO70370 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtssO70370 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtssO70370 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtssO70370 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtssO70370 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtssO70370 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtssO70370 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtssO70370 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtssO70370 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtssO70370 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtssO70370 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CtssO70370 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtssO70370 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CtssO70370 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtssO70370 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtssO70370 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtssO70370 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtssO70370 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtssO70370 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtssO70370 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtssO70370 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtssO70370 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtssO70370 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtssO70370 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CtssO70370 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtssO70370 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtssO70370 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtssO70370 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CtssO70370 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtssO70370 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtssO70370 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtssO70370 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtssO70370 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtssO70370 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtssO70370 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtssO70370 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtssO70370 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtssO70370 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtssO70370 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtssO70370 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtssO70370 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtssO70370 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtssO70370 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtssO70370 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtssO70370 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtssO70370 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtssO70370 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtssO70370 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtssO70370 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtssO70370 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtssO70370 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtssO70370 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms