Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itgb5O70309 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb5O70309 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms