Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RngttO55236 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RngttO55236 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RngttO55236 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RngttO55236 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RngttO55236 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RngttO55236 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RngttO55236 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RngttO55236 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RngttO55236 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RngttO55236 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RngttO55236 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RngttO55236 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RngttO55236 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RngttO55236 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RngttO55236 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RngttO55236 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RngttO55236 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RngttO55236 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RngttO55236 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RngttO55236 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RngttO55236 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RngttO55236 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RngttO55236 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RngttO55236 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RngttO55236 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RngttO55236 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RngttO55236 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RngttO55236 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RngttO55236 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RngttO55236 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RngttO55236 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RngttO55236 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RngttO55236 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RngttO55236 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RngttO55236 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RngttO55236 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RngttO55236 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RngttO55236 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RngttO55236 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RngttO55236 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RngttO55236 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RngttO55236 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RngttO55236 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RngttO55236 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RngttO55236 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RngttO55236 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RngttO55236 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RngttO55236 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RngttO55236 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RngttO55236 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RngttO55236 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RngttO55236 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RngttO55236 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RngttO55236 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RngttO55236 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RngttO55236 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RngttO55236 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RngttO55236 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RngttO55236 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RngttO55236 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RngttO55236 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RngttO55236 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RngttO55236 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RngttO55236 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RngttO55236 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RngttO55236 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RngttO55236 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RngttO55236 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RngttO55236 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RngttO55236 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RngttO55236 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RngttO55236 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RngttO55236 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RngttO55236 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RngttO55236 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RngttO55236 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RngttO55236 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RngttO55236 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RngttO55236 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RngttO55236 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RngttO55236 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RngttO55236 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RngttO55236 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RngttO55236 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RngttO55236 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RngttO55236 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RngttO55236 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RngttO55236 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms