Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChkbO55229 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChkbO55229 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChkbO55229 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChkbO55229 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChkbO55229 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChkbO55229 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ChkbO55229 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChkbO55229 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChkbO55229 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChkbO55229 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms