Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
IlkO55222 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IlkO55222 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IlkO55222 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IlkO55222 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IlkO55222 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IlkO55222 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IlkO55222 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IlkO55222 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IlkO55222 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IlkO55222 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IlkO55222 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IlkO55222 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IlkO55222 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IlkO55222 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IlkO55222 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IlkO55222 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IlkO55222 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IlkO55222 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IlkO55222 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IlkO55222 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IlkO55222 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IlkO55222 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IlkO55222 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IlkO55222 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IlkO55222 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IlkO55222 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IlkO55222 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IlkO55222 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IlkO55222 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IlkO55222 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IlkO55222 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IlkO55222 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IlkO55222 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IlkO55222 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IlkO55222 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IlkO55222 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IlkO55222 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IlkO55222 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IlkO55222 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IlkO55222 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IlkO55222 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IlkO55222 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IlkO55222 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IlkO55222 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IlkO55222 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IlkO55222 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IlkO55222 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IlkO55222 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IlkO55222 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IlkO55222 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IlkO55222 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IlkO55222 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IlkO55222 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IlkO55222 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IlkO55222 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IlkO55222 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IlkO55222 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IlkO55222 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IlkO55222 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IlkO55222 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IlkO55222 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IlkO55222 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IlkO55222 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IlkO55222 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IlkO55222 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IlkO55222 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IlkO55222 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IlkO55222 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IlkO55222 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IlkO55222 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IlkO55222 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IlkO55222 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IlkO55222 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IlkO55222 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IlkO55222 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IlkO55222 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IlkO55222 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IlkO55222 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IlkO55222 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IlkO55222 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IlkO55222 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IlkO55222 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IlkO55222 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IlkO55222 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IlkO55222 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IlkO55222 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IlkO55222 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IlkO55222 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms