Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nck2O55033 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nck2O55033 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nck2O55033 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nck2O55033 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nck2O55033 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nck2O55033 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nck2O55033 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nck2O55033 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nck2O55033 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nck2O55033 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nck2O55033 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nck2O55033 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nck2O55033 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nck2O55033 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nck2O55033 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nck2O55033 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nck2O55033 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nck2O55033 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nck2O55033 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms