Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarce1O54941 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarce1O54941 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarce1O54941 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms