Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DffaO54786 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DffaO54786 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DffaO54786 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DffaO54786 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DffaO54786 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DffaO54786 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DffaO54786 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DffaO54786 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DffaO54786 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DffaO54786 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DffaO54786 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DffaO54786 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DffaO54786 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DffaO54786 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DffaO54786 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DffaO54786 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DffaO54786 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DffaO54786 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DffaO54786 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DffaO54786 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DffaO54786 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DffaO54786 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DffaO54786 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DffaO54786 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DffaO54786 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DffaO54786 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DffaO54786 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DffaO54786 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DffaO54786 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DffaO54786 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DffaO54786 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DffaO54786 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DffaO54786 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DffaO54786 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DffaO54786 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DffaO54786 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DffaO54786 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DffaO54786 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DffaO54786 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DffaO54786 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DffaO54786 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DffaO54786 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DffaO54786 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DffaO54786 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DffaO54786 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DffaO54786 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DffaO54786 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DffaO54786 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DffaO54786 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DffaO54786 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DffaO54786 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DffaO54786 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DffaO54786 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DffaO54786 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DffaO54786 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DffaO54786 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DffaO54786 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DffaO54786 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DffaO54786 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DffaO54786 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DffaO54786 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DffaO54786 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DffaO54786 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DffaO54786 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DffaO54786 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DffaO54786 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DffaO54786 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DffaO54786 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DffaO54786 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DffaO54786 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DffaO54786 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DffaO54786 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DffaO54786 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DffaO54786 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DffaO54786 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DffaO54786 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DffaO54786 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DffaO54786 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DffaO54786 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DffaO54786 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DffaO54786 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DffaO54786 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DffaO54786 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DffaO54786 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DffaO54786 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DffaO54786 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DffaO54786 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DffaO54786 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DffaO54786 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DffaO54786 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DffaO54786 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DffaO54786 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DffaO54786 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DffaO54786 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DffaO54786 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DffaO54786 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DffaO54786 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DffaO54786 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DffaO54786 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms