Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd2O35927 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnnd2O35927 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms