Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf18O35714 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf18O35714 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms