Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rabep1O35551 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rabep1O35551 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rabep1O35551 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
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