Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccrl2O35457 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccrl2O35457 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms