Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnxbO35452 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnxbO35452 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnxbO35452 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnxbO35452 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnxbO35452 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnxbO35452 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnxbO35452 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnxbO35452 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnxbO35452 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms