Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrt1O35449 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt1O35449 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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