Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f3O35261 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f3O35261 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f3O35261 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f3O35261 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f3O35261 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms