Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx3O35160 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms