Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ArxO35085 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ArxO35085 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ArxO35085 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ArxO35085 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ArxO35085 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ArxO35085 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ArxO35085 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ArxO35085 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ArxO35085 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ArxO35085 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ArxO35085 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ArxO35085 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ArxO35085 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ArxO35085 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ArxO35085 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ArxO35085 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ArxO35085 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ArxO35085 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ArxO35085 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ArxO35085 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ArxO35085 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ArxO35085 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ArxO35085 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ArxO35085 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ArxO35085 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ArxO35085 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ArxO35085 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ArxO35085 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ArxO35085 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ArxO35085 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ArxO35085 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ArxO35085 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ArxO35085 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ArxO35085 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ArxO35085 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ArxO35085 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ArxO35085 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ArxO35085 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ArxO35085 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ArxO35085 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ArxO35085 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ArxO35085 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ArxO35085 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ArxO35085 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ArxO35085 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ArxO35085 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ArxO35085 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ArxO35085 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ArxO35085 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ArxO35085 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ArxO35085 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ArxO35085 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ArxO35085 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ArxO35085 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ArxO35085 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ArxO35085 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ArxO35085 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ArxO35085 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ArxO35085 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ArxO35085 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ArxO35085 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ArxO35085 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ArxO35085 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ArxO35085 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ArxO35085 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ArxO35085 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ArxO35085 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ArxO35085 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ArxO35085 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ArxO35085 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ArxO35085 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ArxO35085 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ArxO35085 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ArxO35085 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ArxO35085 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ArxO35085 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ArxO35085 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ArxO35085 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ArxO35085 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ArxO35085 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ArxO35085 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ArxO35085 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ArxO35085 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ArxO35085 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ArxO35085 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ArxO35085 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ArxO35085 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ArxO35085 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ArxO35085 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ArxO35085 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ArxO35085 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ArxO35085 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ArxO35085 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ArxO35085 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ArxO35085 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ArxO35085 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ArxO35085 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ArxO35085 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ArxO35085 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms