Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn4O35054 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn4O35054 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.9 ms