Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NumblO08919 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NumblO08919 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NumblO08919 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NumblO08919 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NumblO08919 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NumblO08919 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NumblO08919 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NumblO08919 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NumblO08919 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NumblO08919 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NumblO08919 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NumblO08919 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NumblO08919 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NumblO08919 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NumblO08919 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NumblO08919 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NumblO08919 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NumblO08919 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NumblO08919 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NumblO08919 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NumblO08919 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NumblO08919 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NumblO08919 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NumblO08919 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NumblO08919 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NumblO08919 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NumblO08919 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NumblO08919 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NumblO08919 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NumblO08919 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NumblO08919 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NumblO08919 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NumblO08919 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NumblO08919 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NumblO08919 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NumblO08919 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NumblO08919 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NumblO08919 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NumblO08919 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NumblO08919 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NumblO08919 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NumblO08919 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NumblO08919 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NumblO08919 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NumblO08919 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NumblO08919 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NumblO08919 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NumblO08919 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NumblO08919 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NumblO08919 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NumblO08919 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NumblO08919 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NumblO08919 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NumblO08919 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NumblO08919 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NumblO08919 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NumblO08919 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NumblO08919 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NumblO08919 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NumblO08919 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NumblO08919 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NumblO08919 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NumblO08919 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NumblO08919 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NumblO08919 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NumblO08919 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NumblO08919 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NumblO08919 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NumblO08919 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NumblO08919 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NumblO08919 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NumblO08919 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NumblO08919 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NumblO08919 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NumblO08919 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NumblO08919 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NumblO08919 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NumblO08919 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NumblO08919 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NumblO08919 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NumblO08919 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NumblO08919 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NumblO08919 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NumblO08919 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NumblO08919 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms