Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CckarO08786 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CckarO08786 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CckarO08786 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CckarO08786 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CckarO08786 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CckarO08786 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CckarO08786 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CckarO08786 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CckarO08786 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CckarO08786 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CckarO08786 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CckarO08786 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CckarO08786 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CckarO08786 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CckarO08786 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CckarO08786 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CckarO08786 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CckarO08786 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CckarO08786 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CckarO08786 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CckarO08786 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CckarO08786 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CckarO08786 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CckarO08786 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CckarO08786 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CckarO08786 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CckarO08786 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CckarO08786 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckarO08786 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckarO08786 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckarO08786 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckarO08786 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckarO08786 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckarO08786 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckarO08786 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckarO08786 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckarO08786 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckarO08786 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckarO08786 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckarO08786 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CckarO08786 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CckarO08786 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckarO08786 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CckarO08786 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckarO08786 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckarO08786 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckarO08786 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckarO08786 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckarO08786 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckarO08786 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckarO08786 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckarO08786 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckarO08786 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckarO08786 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckarO08786 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckarO08786 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CckarO08786 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CckarO08786 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckarO08786 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckarO08786 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckarO08786 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckarO08786 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CckarO08786 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckarO08786 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CckarO08786 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CckarO08786 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CckarO08786 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CckarO08786 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckarO08786 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckarO08786 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckarO08786 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckarO08786 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckarO08786 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckarO08786 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckarO08786 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckarO08786 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckarO08786 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckarO08786 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckarO08786 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckarO08786 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckarO08786 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckarO08786 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckarO08786 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CckarO08786 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CckarO08786 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckarO08786 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckarO08786 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckarO08786 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckarO08786 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckarO08786 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckarO08786 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckarO08786 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckarO08786 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckarO08786 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckarO08786 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CckarO08786 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckarO08786 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckarO08786 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckarO08786 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms