Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfil3O08750 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nfil3O08750 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms