Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp12O08736 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp12O08736 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp12O08736 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Casp12O08736 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp12O08736 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp12O08736 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp12O08736 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp12O08736 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms