Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp35M0QWN7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp35M0QWN7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms