Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2al1oL7MU04 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2al1oL7MU04 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms