Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm4791J3QQ14 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm4791J3QQ14 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm4791J3QQ14 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms