Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm21887J3QQ04 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm21887J3QQ04 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm21887J3QQ04 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm21887J3QQ04 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm21887J3QQ04 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm21887J3QQ04 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21887J3QQ04 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21887J3QQ04 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21887J3QQ04 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21887J3QQ04 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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