Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top6blJ3QMY9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top6blJ3QMY9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms