Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3336J3QMQ6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3336J3QMQ6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3336J3QMQ6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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