Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21060J3KMU4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21060J3KMU4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21060J3KMU4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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