Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AK157302I3ITR1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AK157302I3ITR1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
AK157302I3ITR1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AK157302I3ITR1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms