Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfp408H7BX78 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp408H7BX78 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp408H7BX78 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms